Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc39Q9D5Y1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms