Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms