Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lpcat2bQ9D5U0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms