Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sf3a3Q9D554 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3a3Q9D554 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms