Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc130Q9D516 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms