Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms