Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syce1Q9D495 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms