Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms