Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3R6

Katnal2, Katanin p60 ATPase-containing subunit A-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnal2Q9D3R6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Katnal2Q9D3R6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Katnal2Q9D3R6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Katnal2Q9D3R6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Katnal2Q9D3R6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Katnal2Q9D3R6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Katnal2Q9D3R6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Katnal2Q9D3R6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Katnal2Q9D3R6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Katnal2Q9D3R6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Katnal2Q9D3R6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Katnal2Q9D3R6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Katnal2Q9D3R6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Katnal2Q9D3R6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Katnal2Q9D3R6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms