Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rufy3Q9D394 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms