Protein–RNA interactions for Protein: Q9D304

Rnf128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf128Q9D304 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf128Q9D304 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf128Q9D304 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf128Q9D304 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf128Q9D304 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf128Q9D304 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf128Q9D304 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf128Q9D304 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf128Q9D304 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf128Q9D304 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf128Q9D304 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf128Q9D304 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf128Q9D304 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf128Q9D304 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf128Q9D304 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf128Q9D304 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf128Q9D304 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf128Q9D304 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf128Q9D304 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf128Q9D304 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf128Q9D304 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf128Q9D304 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf128Q9D304 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf128Q9D304 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf128Q9D304 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf128Q9D304 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf128Q9D304 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf128Q9D304 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf128Q9D304 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf128Q9D304 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf128Q9D304 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf128Q9D304 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf128Q9D304 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf128Q9D304 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf128Q9D304 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf128Q9D304 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf128Q9D304 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf128Q9D304 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf128Q9D304 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf128Q9D304 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf128Q9D304 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf128Q9D304 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf128Q9D304 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf128Q9D304 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf128Q9D304 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf128Q9D304 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf128Q9D304 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf128Q9D304 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf128Q9D304 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms