Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snx20Q9D2Y5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snx20Q9D2Y5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx20Q9D2Y5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx20Q9D2Y5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx20Q9D2Y5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx20Q9D2Y5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx20Q9D2Y5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx20Q9D2Y5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx20Q9D2Y5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx20Q9D2Y5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx20Q9D2Y5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx20Q9D2Y5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx20Q9D2Y5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx20Q9D2Y5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx20Q9D2Y5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx20Q9D2Y5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx20Q9D2Y5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx20Q9D2Y5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx20Q9D2Y5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx20Q9D2Y5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx20Q9D2Y5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx20Q9D2Y5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx20Q9D2Y5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx20Q9D2Y5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx20Q9D2Y5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx20Q9D2Y5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx20Q9D2Y5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx20Q9D2Y5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms