Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Snapc3Q9D2C9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snapc3Q9D2C9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snapc3Q9D2C9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snapc3Q9D2C9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snapc3Q9D2C9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Snapc3Q9D2C9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Snapc3Q9D2C9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snapc3Q9D2C9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Snapc3Q9D2C9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snapc3Q9D2C9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snapc3Q9D2C9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snapc3Q9D2C9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snapc3Q9D2C9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snapc3Q9D2C9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Snapc3Q9D2C9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Snapc3Q9D2C9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Snapc3Q9D2C9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snapc3Q9D2C9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Snapc3Q9D2C9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snapc3Q9D2C9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snapc3Q9D2C9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snapc3Q9D2C9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snapc3Q9D2C9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snapc3Q9D2C9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snapc3Q9D2C9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snapc3Q9D2C9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snapc3Q9D2C9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snapc3Q9D2C9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snapc3Q9D2C9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snapc3Q9D2C9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snapc3Q9D2C9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Snapc3Q9D2C9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Snapc3Q9D2C9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snapc3Q9D2C9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snapc3Q9D2C9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snapc3Q9D2C9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snapc3Q9D2C9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Snapc3Q9D2C9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms