Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0U9

Arv1, Protein ARV1, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arv1Q9D0U9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arv1Q9D0U9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Arv1Q9D0U9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arv1Q9D0U9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arv1Q9D0U9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arv1Q9D0U9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arv1Q9D0U9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Arv1Q9D0U9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arv1Q9D0U9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arv1Q9D0U9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arv1Q9D0U9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arv1Q9D0U9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arv1Q9D0U9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arv1Q9D0U9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arv1Q9D0U9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arv1Q9D0U9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arv1Q9D0U9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arv1Q9D0U9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arv1Q9D0U9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arv1Q9D0U9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arv1Q9D0U9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arv1Q9D0U9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arv1Q9D0U9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arv1Q9D0U9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arv1Q9D0U9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arv1Q9D0U9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arv1Q9D0U9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arv1Q9D0U9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arv1Q9D0U9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arv1Q9D0U9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arv1Q9D0U9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arv1Q9D0U9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arv1Q9D0U9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arv1Q9D0U9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arv1Q9D0U9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arv1Q9D0U9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arv1Q9D0U9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms