Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc47Q9D024 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
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