Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms