Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shmt2Q9CZN7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Shmt2Q9CZN7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shmt2Q9CZN7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shmt2Q9CZN7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Shmt2Q9CZN7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shmt2Q9CZN7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms