Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrs1Q9CYH6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms