Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Exo5Q9CXP9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms