Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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