Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms