Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Prdm5Q9CXE0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Prdm5Q9CXE0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Prdm5Q9CXE0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
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