Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX30

Yif1b, Protein YIF1B, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yif1bQ9CX30 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Yif1bQ9CX30 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Yif1bQ9CX30 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Yif1bQ9CX30 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Yif1bQ9CX30 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Yif1bQ9CX30 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Yif1bQ9CX30 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Yif1bQ9CX30 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Yif1bQ9CX30 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Yif1bQ9CX30 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Yif1bQ9CX30 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Yif1bQ9CX30 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Yif1bQ9CX30 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Yif1bQ9CX30 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms