Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnih4Q9CX13 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnih4Q9CX13 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnih4Q9CX13 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnih4Q9CX13 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnih4Q9CX13 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnih4Q9CX13 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnih4Q9CX13 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnih4Q9CX13 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnih4Q9CX13 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnih4Q9CX13 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnih4Q9CX13 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnih4Q9CX13 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnih4Q9CX13 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnih4Q9CX13 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnih4Q9CX13 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnih4Q9CX13 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnih4Q9CX13 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnih4Q9CX13 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnih4Q9CX13 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnih4Q9CX13 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnih4Q9CX13 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnih4Q9CX13 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnih4Q9CX13 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnih4Q9CX13 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnih4Q9CX13 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnih4Q9CX13 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnih4Q9CX13 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnih4Q9CX13 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnih4Q9CX13 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms