Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWR2

Smyd3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd3Q9CWR2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smyd3Q9CWR2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smyd3Q9CWR2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smyd3Q9CWR2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smyd3Q9CWR2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smyd3Q9CWR2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smyd3Q9CWR2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smyd3Q9CWR2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smyd3Q9CWR2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smyd3Q9CWR2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smyd3Q9CWR2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smyd3Q9CWR2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smyd3Q9CWR2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Smyd3Q9CWR2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smyd3Q9CWR2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smyd3Q9CWR2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smyd3Q9CWR2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smyd3Q9CWR2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smyd3Q9CWR2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smyd3Q9CWR2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smyd3Q9CWR2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smyd3Q9CWR2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smyd3Q9CWR2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smyd3Q9CWR2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smyd3Q9CWR2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smyd3Q9CWR2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smyd3Q9CWR2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smyd3Q9CWR2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smyd3Q9CWR2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smyd3Q9CWR2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smyd3Q9CWR2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms