Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms