Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms