Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Sft2d3Q9CSV6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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