Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRW3

UPF0538 protein C2orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRW3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CRW3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CRW3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CRW3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CRW3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CRW3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CRW3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CRW3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CRW3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CRW3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CRW3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CRW3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CRW3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CRW3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CRW3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CRW3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CRW3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CRW3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CRW3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CRW3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CRW3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CRW3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CRW3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CRW3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CRW3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CRW3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CRW3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CRW3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CRW3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CRW3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CRW3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CRW3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CRW3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CRW3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CRW3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CRW3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CRW3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms