Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR63

Cox16, Cytochrome c oxidase assembly protein COX16 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox16Q9CR63 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cox16Q9CR63 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cox16Q9CR63 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cox16Q9CR63 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cox16Q9CR63 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cox16Q9CR63 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cox16Q9CR63 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cox16Q9CR63 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cox16Q9CR63 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cox16Q9CR63 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cox16Q9CR63 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cox16Q9CR63 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cox16Q9CR63 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cox16Q9CR63 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cox16Q9CR63 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cox16Q9CR63 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cox16Q9CR63 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cox16Q9CR63 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cox16Q9CR63 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cox16Q9CR63 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cox16Q9CR63 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cox16Q9CR63 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cox16Q9CR63 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cox16Q9CR63 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cox16Q9CR63 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cox16Q9CR63 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cox16Q9CR63 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cox16Q9CR63 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms