Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg12Q9CQY1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms