Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

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Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Ifitm3Q9CQW9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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Ifitm3Q9CQW9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Ifitm3Q9CQW9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Ifitm3Q9CQW9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Ifitm3Q9CQW9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms