Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms