Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS5

Riok2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok2Q9CQS5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riok2Q9CQS5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Riok2Q9CQS5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riok2Q9CQS5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riok2Q9CQS5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riok2Q9CQS5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Riok2Q9CQS5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Riok2Q9CQS5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Riok2Q9CQS5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Riok2Q9CQS5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Riok2Q9CQS5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Riok2Q9CQS5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Riok2Q9CQS5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Riok2Q9CQS5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Riok2Q9CQS5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Riok2Q9CQS5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Riok2Q9CQS5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Riok2Q9CQS5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Riok2Q9CQS5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Riok2Q9CQS5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Riok2Q9CQS5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riok2Q9CQS5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riok2Q9CQS5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riok2Q9CQS5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riok2Q9CQS5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riok2Q9CQS5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riok2Q9CQS5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riok2Q9CQS5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riok2Q9CQS5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riok2Q9CQS5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Riok2Q9CQS5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riok2Q9CQS5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riok2Q9CQS5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riok2Q9CQS5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Riok2Q9CQS5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riok2Q9CQS5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riok2Q9CQS5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riok2Q9CQS5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riok2Q9CQS5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riok2Q9CQS5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riok2Q9CQS5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Riok2Q9CQS5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Riok2Q9CQS5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Riok2Q9CQS5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Riok2Q9CQS5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riok2Q9CQS5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms