Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Smim8Q9CQQ0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Smim8Q9CQQ0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Smim8Q9CQQ0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Smim8Q9CQQ0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms