Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK1

Znhit3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znhit3Q9CQK1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms