Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CQF4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CQF4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQF4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQF4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQF4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CQF4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms