Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms