Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CQC3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CQC3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQC3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQC3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQC3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQC3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQC3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CQC3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CQC3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q9CQC3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CQC3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms