Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ76

Nepn, Nephrocan, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NepnQ9CQ76 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NepnQ9CQ76 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms