Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nudcd2Q9CQ48 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nudcd2Q9CQ48 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nudcd2Q9CQ48 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nudcd2Q9CQ48 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nudcd2Q9CQ48 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nudcd2Q9CQ48 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nudcd2Q9CQ48 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nudcd2Q9CQ48 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nudcd2Q9CQ48 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nudcd2Q9CQ48 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nudcd2Q9CQ48 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nudcd2Q9CQ48 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nudcd2Q9CQ48 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nudcd2Q9CQ48 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nudcd2Q9CQ48 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nudcd2Q9CQ48 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nudcd2Q9CQ48 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nudcd2Q9CQ48 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nudcd2Q9CQ48 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms