Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole4Q9CQ36 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole4Q9CQ36 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole4Q9CQ36 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole4Q9CQ36 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole4Q9CQ36 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole4Q9CQ36 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole4Q9CQ36 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole4Q9CQ36 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole4Q9CQ36 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pole4Q9CQ36 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms