Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ20

Mid1ip1, Mid1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1ip1Q9CQ20 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms