Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chmp3Q9CQ10 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms