Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms