Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Commd4Q9CQ02 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd4Q9CQ02 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms