Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ccdc198Q9CPZ1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ccdc198Q9CPZ1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ccdc198Q9CPZ1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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