Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms