Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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