Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Smim3Q99PE5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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